光纤熔接机具有多种不同的程序，允许对不同的光纤进行处理。程序具有一些可变的参数，包括长度、时间、对于保护套的处理时间和处理温度等。这些程序能够很容易的储存到记忆体中，以备在必要的时候调出来使用。

操作光纤熔接机并不复杂，可是也不至于简略到操作预磨连接器那么简略。操作预磨连接器时，操作人员能够站在梯子上，将头探到天花板里，在黯淡的环境中成功的连接了预磨连接器，即使是在极端困难的环境中，预磨连接器的操作也能够完结的极好。可是要记住：并非所有的光纤端接都会具有杰出的操作条件。

光纤熔接机的第一步是安装一个熔接保护套，然后在光纤剥脱和劈裂产生断面后，将其放置到正确熔接的位置，熔接需要保证两个光纤的端面具有一个合适的同轴位置，然后将光纤保护起来，关上门。然后操作人员将光纤转移到合适的位置，准备熔接和点火。熔接以后，一些熔接机还能够对熔接点进行简要的测试。然后将光纤移开，将保护套滑到熔接点位置，对保护套进行加热，产生热缩，保护光缆。操作人员需要花费大量的时间来进行光纤位置的确认和保护套管的处理。